El trabajo “A Proteome-Scale Map of the Human Interactome Network”, recientemente publicado por la revista Cell, ha sido producto de colaboración científica internacional desde 2009. Globalmente ha sido dirigido por el grupo del Dr. Marc Vidal de la Universidad de Harvard y del Dana-Farber Cancer Institute (en Boston, USA) y de manera específica la dirección de los estudios de bioinformática han sido llevados a cabo a lo largo de estos cinco años por el Dr. Javier de las Rivas, investigador principal del Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC) centro mixto de la Universidad de Salamanca y del Consejo Superior de Investigaciones Científicas.
Al igual que las secuencias del genoma revolucionaron la genética humana, los mapas de la referencia de redes de interactoma serán fundamentales para comprender plenamente las relaciones genotipo-fenotipo (para comparar la información contenida en los cromosomas con su manifestación y relación con el medio). Es decir, los científicos están trabajando para identificar de manera sistemática las interacciones de las proteínas dentro de un organismo.
Para la realización de estos experimentos es necesario disponer en el laboratorio de un banco con todos o casi todos los genes humanos clonados que permitan expresar y testar las proteínas. Esta plataforma ha sido construida en el laboratorio del Dr. Vidal en Boston en la última década.
En el trabajo “A Proteome-Scale Map of the Human Interactome Network” se ha descrito un mapa de aproximadamente 14.000 interacciones binarias proteína-proteína humanas de alta calidad. Aunque la información actual de la red presentada cubre una porción relativamente pequeña del proteoma, el mapa es más homogéneo y revela una red más amplia de las interacciones de las proteínas de los humanos, que proporciona datos para precisar aspectos funcionales del cáncer. El equipo dirigido por Dr. De las Rivas ha testado 1000 proteínas del set de referencia, por tanto, las muestras se han analizado mediante tres métodos independientes y cotejados por métodos bioinformáticos.
El estudio ha permitido describir con más precisión las proteínas implicadas en el desarrollo del cáncer (también conocidas como oncoproteínas) y se ha constatado una gran cantidad de relaciones entre ellas, por esta razón los científicos las denominan “nodos críticos” de una red. Este avance puede tener una aplicación directa en clínica debido a que muchos de los tratamientos del cáncer consisten en restablecer relaciones normales para dichas oncoproteínas,deshaciendo algunas relaciones que son claramente perjudiciales y malignas para nuestras células.
El trabajo ha sido producto de la colaboración de investigadores que desarrollan su trabajo en Estados Unidos, Canadá, Bélgica y España.
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